La tortuga gigante de Aldabra es una de las dos únicas especies de tortugas gigantes que quedan en el mundo y actualmente se encuentra en la lista de amenazas. Los esfuerzos de conservación están en marcha, pero se necesitan con urgencia más y mejores herramientas para mejorar las posibilidades de éxito a largo plazo. Un estudio publicado hoy por un equipo internacional de investigadores proporcionó tal herramienta: han completado y publicado una secuencia del genoma de muy alta calidad que ayudará a asegurar un futuro para esta especie en peligro de extinción.
Josedi Gilger de la Universidad de Zúrich y colegas de todo el mundo han proporcionado exactamente esta información utilizando una combinación de métodos de última generación para lograr una representación de Aldabra a «escala cromosómica». tortuga gigante genoma; Este trabajo fue publicado en la revista gigaciencia.
Las tortugas gigantes se pueden encontrar en Madagascar y en una variedad de islas en el Océano Índico occidental. Según los registros fósiles, se han encontrado tortugas gigantes en todos los continentes excepto en la Antártida y Australia. Hoy en día, solo existen tortugas gigantes: la tortuga gigante de Aldabra y la tortuga gigante de Galápagos. La tortuga gigante de Aldabra (Aldabrachelys gigantea) puede pesar hasta 300 kg, por lo general vive más de 100 años, y se dice que un individuo tiene 250 años; si es así, sería el vertebrado terrestre más antiguo registrado.
Aldabrachelys gigantea todavía vive en su hábitat nativo, el atolón de Aldabra al noroeste de Madagascar, pero el gentil gigante es «vulnerable» según la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza, lo que significa que la especie está en peligro de extinción en estado salvaje. Contar con más herramientas y recursos, en particular Información genéticaes una de las mejores maneras de asegurar el éxito a largo plazo de esta asombrosa criatura.
El investigador principal, Gillinger, enfatizó este punto y dijo: «La información genómica es importante para los esfuerzos de reproducción en los zoológicos, para mantener la diversidad genética que se encuentra en la naturaleza». También habló sobre las formas más completas en que estos datos pueden ser útiles, en particular, cómo pueden ayudar en estudios comparativos con otras especies de tortugas terrestres y terrestres, y agregó: «Revelamos que la mayoría de los genomas son similares a otros genomas de testodina conocidos ( el sistema consta de tortugas y tortugas terrestres). Las especies de tortugas están evolutivamente estrechamente relacionadas entre sí, por lo que nuestros datos serán muy útiles no solo para la tortuga de Aldabra, sino para todas las tortugas de África oriental y Madagascar».
los secuencia del genoma Los datos que los autores encuentran aquí están a la vanguardia de lo que se está haciendo en el campo de la secuenciación del genoma, que implementa la secuenciación del genoma a la «escala cromosómica». Este término se utiliza cuando Datos de secuenciación del genoma Es una representación casi libre de espacios de las secuencias de más de dos mil millones de «letras» genéticas, y las secuencias están alineadas en el mismo orden en que aparecen en los cromosomas reales. Las secuencias genómicas anteriores no solo tenían vacuolas mucho más grandes, sino que también tenían vacuolas datos de secuenciación Se disponen en los llamados «andamiajes», que son secuencias dispuestas en orden relativo entre sí, pero no completamente fijas en el espacio con respecto al cromosoma.
Las secuencias cromosómicas actuales de todo el genoma proporcionan información genética tan precisa que permite a los investigadores rastrear con mayor precisión la variación genética en tortugas silvestres y cautivas. Para ilustrar cómo se puede usar el nuevo genoma de referencia en los esfuerzos prácticos de conservación y reproducción, los autores secuenciaron treinta tortugas gigantes salvajes y dos individuos del zoológico de Zúrich. Usando estos datos junto con un genoma de referencia de alta calidad, pudieron determinar en qué parte del atolón de Aldabra se originaron originalmente los animales en el zoológico.
Por lo tanto, tener disponible un genoma de referencia de alta calidad para esta especie ayudará a responder una variedad de preguntas biológicas, por ejemplo, para comprender por qué la especie ha crecido hasta un tamaño tan gigantesco. Con un apetito acorde con su tamaño, las tortugas gigantes juegan un papel importante en la configuración del paisaje de la isla, debido a la gran cantidad de plantas que consumen. De hecho, después de reintroducir las tortugas gigantes en su hábitat natural y ayudarlas a prosperar, puede permitirles servir como una alternativa ecológica a las tortugas gigantes extintas en las islas del Océano Índico occidental, dado su papel central similar en sus ecosistemas. Las tortugas gigantes de Aldabra están trabajando como ingenieras de ecosistemas para restaurar los hábitats insulares degradados, incluso fuera de su área de origen.
Restaurar los mecanismos para proteger el medio ambiente natural es un componente esencial para hacer más que reducir el riesgo de extinción de especies individuales.
FG Çilingir et al, El ensamblaje del genoma a nivel cromosómico de la tortuga gigante de Aldabra permite conocer la salud genética de una población amenazada, gigaciencia (2022). DOI: 10.1093/giascience/giac090. www.biorxiv.org/content/10.110… 20.488802v1.abstract
Proporcionado por GigaScience
La frase: Genome of Genome Genome Chromosome Scale Allows Insight into Genetic Health of a Threatened Population (2022, 11 de octubre) Obtenido el 11 de octubre de 2022 de https://phys.org/news/2022-10-chromosome-scale-genome-gentle- características-gigantes.html
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