En un estudio reciente publicado en bioRxiv* Servidor de preimpresión, los investigadores realizaron un análisis dinámico y epidemiológico para evaluar las características del coronavirus-2 (SARS-CoV-2) Omicrón de preocupación (VOC) sub-VOC XBB.1.5.
antecedentes
La enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) ha resultado en tasas de morbilidad y mortalidad sin precedentes a escala mundial. La eficacia de las vacunas contra la COVID-19 y otros agentes terapéuticos, como los anticuerpos monoclonales, se ha visto cuestionada por la continua aparición de variantes del SARS-CoV-2 con mayor transmisibilidad, infectividad, inmunoevasividad y aptitud viral.
Los autores del estudio actual informaron previamente las características virales de varios sub-COV nuevos de Omicron. Para diciembre de 2022, apareció Omicron XBB.1.5 sub-VOC, que se deriva de XBB.1 sub-VOC, una proteína de pico que contiene la mutación F486P, y estaba circulando rápidamente en los Estados Unidos de América (EE. UU.) y otras partes del mundo. mundo desde entonces. Se necesita más investigación para determinar las características virales de las nuevas variantes emergentes para informar la formulación de políticas y guiar el desarrollo de vacunas actualizadas para reducir la carga de salud de COVID-19.
sobre estudiar
El estudio actual amplió el análisis previo de los investigadores al dilucidar las características de XBB.1.5.
Se realizaron ensayos de presentación de superficie de levadura y ensayos de pseudovirus para evaluar la afinidad de la interacción de unión de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) y la infectividad de XBB.1.5, respectivamente . Para los ensayos de pseudovirus, las células HOS que expresan de manera estable ACE2 humana y serina proteasa 2 (TMPRSS2) se infectaron con pseudovirus SARS-CoV-2 que comprenden proteínas de pico alteradas. Las entradas virales se normalizaron en función de las cantidades de proteína de la cápside p24 (VIH-1) (VIH-1).
Además, se realizaron ensayos de neutralización de SARS-CoV-2 para evaluar la resistencia a los sueros de sub-VOC Omicron BA.2 y Omicron BA.5 sub-VOC (BTI), utilizando pseudovirus que comprenden proteínas de punta de la cepa B.1.1, BA. 2, cepa BA.5, cepa BQ.1.1, cepa XBB.1, cepa XBB.1 sin mutación S: Y144del (XBB.1 + ins144Y), cepa XBB.1.5 y cepa XBB.1.5 sin mutación S : Y144del (XBB.1.5 + ins144Y).
Se obtuvieron muestras de suero de 13 convalecientes de COVID-19 que recibieron vacunas completas de COVID-19 y tenían antecedentes de infección por Omicron BA.2 después de la vacunación completa de COVID-19, en los que nueve personas recibieron dos dosis y cuatro personas recibieron tres dosis de Vacunas COVID-19 -19.
Además, se obtuvieron sueros de 20 convalecientes Omicron BA.5, de los cuales dos sujetos, 17 individuos y un individuo habían recibido dos, tres y cuatro dosis de vacunas COVID-19, respectivamente. Para todas las muestras de suero, el equipo realizó ensayos por triplicado para determinar NT50 (50 por ciento de neutralización) Calibre. Todas las características virales evaluadas se compararon con las de la cepa parental XBB.1. El análisis bayesiano se realizó utilizando un intervalo de confianza (IC) del 95 por ciento.
resultados
La tasa de reproducción relativa estimada de la cepa XBB.1.5 fue >1,20 veces mayor que la de la cepa parental XBB.1, y la cepa XBB.1.5 superó a la cepa BQ.1.1 que prevaleció en EE. UU. en diciembre. A partir de 2022. Los resultados indicaron que la cepa XBB.1.5 se propagará rápidamente a nivel mundial en los tiempos venideros.
La infectividad estimada y la afinidad de unión a ACE de la cepa XBB.1.5 fueron tres y cuatro veces mayores que las características correspondientes de la cepa XBB.1, respectivamente. Los resultados indicaron que la cepa XBB.1.5 mostró una afinidad significativamente mayor por la unión a ACE2 debido a la mutación F486P, mientras que la mutación 144Y resultó en una tasa de infección más alta de la cepa XBB.1. La mutación 144Y no mejoró la infección de la cepa XBB.1.5.
La cepa XBB.1.5 mostró una fuerte resistencia a los sueros Omicron BA.2 BTI (41,0 veces frente a la cepa B.1.1, 20,0 veces frente a la cepa Omicron BA.2) y sueros BA.5 BTI (32,0 veces frente a la cepa B .1.1 cepa, 10 veces frente a Omicron cepa BA.5), respectivamente. La mutación de inserción 144Y mejoró significativamente la sensibilidad de XBB.2.5 a los sueros Omicron BA.2 sub-VOC BTI y Omicron BA.5 sub-VOC BTI. La inmunorreactividad de la cepa XBB.1.5 y la cepa XBB.1 original fueron comparables.
Además, parte de la cepa XBB.1.5 perdió la mutación S:Y144del, que aumenta la elusividad inmunitaria pero reduce la infectividad. Sin embargo, la cepa XBB.1.5 que carecía de la mutación S:Y144del (XBB.1.5 + ins144Y) mostró un número de reproducción efectivo relativamente más bajo que la cepa XBB.1.5 original.
En general, los resultados del análisis de dinámica epidemiológica mostraron que la nueva cepa XBB.1.5 es la cepa XBB más lograda hasta la fecha, que alberga la mutación F486P en la proteína de pico, que ha mejorado la afinidad de unión al receptor ACE-2 sin pérdida observable. de resistencia inmunogénica, lo que conduce a una mayor portabilidad.
*Nota IMPORTANTE
bioRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, dirigir la práctica clínica o el comportamiento relacionado con la salud, ni tratarse como información sólida.
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